MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 2

Total Repeats: 7650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017552	TGAA	2	8	12	19	50 %	25 %	25 %	0 %	386076038
2	NC_017552	AAATC	2	10	67	76	60 %	20 %	0 %	20 %	386076038
3	NC_017552	TCAA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	386076038
4	NC_017552	TTCA	2	8	199	206	25 %	50 %	0 %	25 %	386076038
5	NC_017552	T	7	7	224	230	0 %	100 %	0 %	0 %	386076038
6	NC_017552	A	6	6	316	321	100 %	0 %	0 %	0 %	386076038
7	NC_017552	TC	3	6	414	419	0 %	50 %	0 %	50 %	386076038
8	NC_017552	TGGT	2	8	524	531	0 %	50 %	50 %	0 %	386076038
9	NC_017552	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
10	NC_017552	CCT	2	6	611	616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076038
11	NC_017552	T	7	7	638	644	0 %	100 %	0 %	0 %	386076038
12	NC_017552	TTA	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076038
13	NC_017552	GAT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076038
14	NC_017552	ATT	2	6	695	700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076038
15	NC_017552	GAA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
16	NC_017552	ACGT	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	386076038
17	NC_017552	AGTT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	386076038
18	NC_017552	AGAAA	2	10	799	808	80 %	0 %	20 %	0 %	386076038
19	NC_017552	ACAA	2	8	876	883	75 %	0 %	0 %	25 %	386076038
20	NC_017552	GGTCT	2	10	922	931	0 %	40 %	40 %	20 %	386076038
21	NC_017552	TGC	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076038
22	NC_017552	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	386076038
23	NC_017552	CGGAGA	2	12	1040	1051	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386076038
24	NC_017552	AAG	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
25	NC_017552	ATG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076038
26	NC_017552	ACG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076038
27	NC_017552	A	6	6	1302	1307	100 %	0 %	0 %	0 %	386076038
28	NC_017552	GAT	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076038
29	NC_017552	ACT	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076038
30	NC_017552	A	6	6	1424	1429	100 %	0 %	0 %	0 %	386076038
31	NC_017552	GAA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
32	NC_017552	AAG	2	6	1537	1542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
33	NC_017552	GTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076038
34	NC_017552	GAC	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076038
35	NC_017552	TCC	3	9	1793	1801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076038
36	NC_017552	GAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
37	NC_017552	GAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076038
38	NC_017552	TTC	3	9	1919	1927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
39	NC_017552	TGG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076038
40	NC_017552	CTT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
41	NC_017552	A	6	6	2120	2125	100 %	0 %	0 %	0 %	386076038
42	NC_017552	T	6	6	2145	2150	0 %	100 %	0 %	0 %	386076038
43	NC_017552	CGG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076038
44	NC_017552	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
45	NC_017552	CGG	2	6	2434	2439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076038
46	NC_017552	TTC	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
47	NC_017552	AAT	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386076038
48	NC_017552	TCC	2	6	2604	2609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076039
49	NC_017552	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076039
50	NC_017552	ATC	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076039
51	NC_017552	AGGAGA	2	12	2883	2894	50 %	0 %	50 %	0 %	386076039
52	NC_017552	A	6	6	2899	2904	100 %	0 %	0 %	0 %	386076039
53	NC_017552	GGT	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076039
54	NC_017552	AGA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
55	NC_017552	GACT	2	8	3063	3070	25 %	25 %	25 %	25 %	386076039
56	NC_017552	T	8	8	3086	3093	0 %	100 %	0 %	0 %	386076039
57	NC_017552	TTAG	2	8	3124	3131	25 %	50 %	25 %	0 %	386076039
58	NC_017552	CTT	2	6	3179	3184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076039
59	NC_017552	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	386076039
60	NC_017552	AAG	2	6	3254	3259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
61	NC_017552	GAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
62	NC_017552	AGA	2	6	3286	3291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
63	NC_017552	AG	3	6	3319	3324	50 %	0 %	50 %	0 %	386076039
64	NC_017552	TCAA	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	386076039
65	NC_017552	TGT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017552	GTT	2	6	3473	3478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017552	AATT	2	8	3483	3490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017552	AGT	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017552	TTTTG	2	10	3601	3610	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017552	TTCT	2	8	3698	3705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017552	TAG	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017552	T	6	6	3867	3872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017552	GAAA	2	8	3875	3882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017552	AT	3	6	3928	3933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017552	AGTT	2	8	3947	3954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017552	T	6	6	3963	3968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017552	GGA	2	6	4024	4029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017552	TTTG	2	8	4056	4063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017552	TTCTTT	2	12	4075	4086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386076040
80	NC_017552	GGT	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076040
81	NC_017552	A	6	6	4097	4102	100 %	0 %	0 %	0 %	386076040
82	NC_017552	GTAT	2	8	4239	4246	25 %	50 %	25 %	0 %	386076040
83	NC_017552	TCT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
84	NC_017552	TTCC	2	8	4312	4319	0 %	50 %	0 %	50 %	386076040
85	NC_017552	TC	3	6	4332	4337	0 %	50 %	0 %	50 %	386076040
86	NC_017552	TGT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076040
87	NC_017552	TTC	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
88	NC_017552	CCA	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386076040
89	NC_017552	TTC	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
90	NC_017552	AAG	2	6	4486	4491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076040
91	NC_017552	GAACCG	2	12	4512	4523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076040
92	NC_017552	AGA	3	9	4553	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076040
93	NC_017552	T	7	7	4593	4599	0 %	100 %	0 %	0 %	386076040
94	NC_017552	T	9	9	4617	4625	0 %	100 %	0 %	0 %	386076040
95	NC_017552	T	6	6	4627	4632	0 %	100 %	0 %	0 %	386076040
96	NC_017552	GAAA	2	8	4720	4727	75 %	0 %	25 %	0 %	386076040
97	NC_017552	GCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076040
98	NC_017552	CGT	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076040
99	NC_017552	TTC	2	6	4789	4794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
100	NC_017552	TGT	2	6	4825	4830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076040
101	NC_017552	GGT	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076040
102	NC_017552	T	6	6	4912	4917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017552	TCT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017552	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017552	T	6	6	4996	5001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017552	TTTAA	2	10	5011	5020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017552	TA	3	6	5108	5113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017552	TAC	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017552	A	6	6	5153	5158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017552	GAA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017552	A	7	7	5202	5208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017552	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017552	TCT	2	6	5329	5334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076041
114	NC_017552	A	6	6	5373	5378	100 %	0 %	0 %	0 %	386076041
115	NC_017552	CAA	2	6	5460	5465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076041
116	NC_017552	AGAA	2	8	5496	5503	75 %	0 %	25 %	0 %	386076041
117	NC_017552	TTC	2	6	5543	5548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076041
118	NC_017552	CCT	2	6	5572	5577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076041
119	NC_017552	GAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076041
120	NC_017552	ATT	2	6	5654	5659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076041
121	NC_017552	T	6	6	5697	5702	0 %	100 %	0 %	0 %	386076041
122	NC_017552	A	6	6	5717	5722	100 %	0 %	0 %	0 %	386076041
123	NC_017552	TTTC	2	8	5737	5744	0 %	75 %	0 %	25 %	386076041
124	NC_017552	A	6	6	5752	5757	100 %	0 %	0 %	0 %	386076041
125	NC_017552	TC	3	6	5788	5793	0 %	50 %	0 %	50 %	386076041
126	NC_017552	ATC	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076041
127	NC_017552	TTTC	2	8	5899	5906	0 %	75 %	0 %	25 %	386076041
128	NC_017552	TGGA	2	8	5918	5925	25 %	25 %	50 %	0 %	386076041
129	NC_017552	TTC	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076041
130	NC_017552	GAA	2	6	6058	6063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076041
131	NC_017552	T	6	6	6104	6109	0 %	100 %	0 %	0 %	386076041
132	NC_017552	AGA	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017552	GCG	2	6	6125	6130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017552	AAC	2	6	6156	6161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017552	TCT	3	9	6167	6175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017552	AAT	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017552	A	8	8	6226	6233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017552	T	6	6	6343	6348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017552	CTT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017552	GTTTT	2	10	6590	6599	0 %	80 %	20 %	0 %	386076042
141	NC_017552	CTC	2	6	6684	6689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076042
142	NC_017552	TC	3	6	6724	6729	0 %	50 %	0 %	50 %	386076042
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271	NC_017552	GA	3	6	12746	12751	50 %	0 %	50 %	0 %	386076047
272	NC_017552	A	6	6	12780	12785	100 %	0 %	0 %	0 %	386076048
273	NC_017552	TCC	2	6	12787	12792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076048
274	NC_017552	GAT	2	6	12799	12804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076048
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411	NC_017552	TTCCAA	2	12	18743	18754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076052
412	NC_017552	AGG	2	6	18764	18769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076052
413	NC_017552	AGA	2	6	18775	18780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076052
414	NC_017552	AAC	2	6	18809	18814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076052
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416	NC_017552	AAG	2	6	19016	19021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076052
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430	NC_017552	GA	3	6	19504	19509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
431	NC_017552	CTG	2	6	19515	19520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_017552	GTTAA	2	10	19611	19620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
433	NC_017552	ATC	2	6	19647	19652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_017552	GATTT	2	10	19699	19708	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
435	NC_017552	TTG	2	6	19728	19733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NC_017552	AATT	2	8	19737	19744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_017552	CAA	2	6	19815	19820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_017552	TAT	2	6	19824	19829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_017552	TAC	2	6	19859	19864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076053
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442	NC_017552	GTA	2	6	19991	19996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076053
443	NC_017552	T	6	6	20024	20029	0 %	100 %	0 %	0 %	386076053
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462	NC_017552	T	8	8	20780	20787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017552	TGGAAG	2	12	20823	20834	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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